Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIP4Q15650 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms