Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNHIT3Q15649 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 277 ms