Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ANKRD1Q15327 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ANKRD1Q15327 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ANKRD1Q15327 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD1Q15327 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms