Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PDCD1Q15116 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PDCD1Q15116 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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