Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SMCO1Q147U7 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms