Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNB1Q14721 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms