Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CKAP5Q14008 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CKAP5Q14008 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CKAP5Q14008 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CKAP5Q14008 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CKAP5Q14008 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CKAP5Q14008 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CKAP5Q14008 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CKAP5Q14008 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CKAP5Q14008 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CKAP5Q14008 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CKAP5Q14008 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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CKAP5Q14008 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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CKAP5Q14008 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CKAP5Q14008 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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CKAP5Q14008 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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CKAP5Q14008 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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CKAP5Q14008 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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CKAP5Q14008 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CKAP5Q14008 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CKAP5Q14008 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CKAP5Q14008 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CKAP5Q14008 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CKAP5Q14008 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CKAP5Q14008 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CKAP5Q14008 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CKAP5Q14008 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
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CKAP5Q14008 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.05■□□□□ 0
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CKAP5Q14008 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CKAP5Q14008 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CKAP5Q14008 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CKAP5Q14008 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CKAP5Q14008 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CKAP5Q14008 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CKAP5Q14008 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CKAP5Q14008 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CKAP5Q14008 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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