Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPSQ13938 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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