Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ALCAMQ13740 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ALCAMQ13740 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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