Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA1SQ13698 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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