Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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