Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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FOXE3Q13461 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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FOXE3Q13461 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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FOXE3Q13461 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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FOXE3Q13461 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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FOXE3Q13461 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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FOXE3Q13461 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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FOXE3Q13461 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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FOXE3Q13461 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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FOXE3Q13461 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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FOXE3Q13461 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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FOXE3Q13461 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FOXE3Q13461 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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