Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms