Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SRSF5Q13243 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SRSF5Q13243 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF5Q13243 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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