Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FMODQ06828 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FMODQ06828 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FMODQ06828 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FMODQ06828 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FMODQ06828 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
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FMODQ06828 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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FMODQ06828 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FMODQ06828 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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FMODQ06828 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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FMODQ06828 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FMODQ06828 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FMODQ06828 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FMODQ06828 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FMODQ06828 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FMODQ06828 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FMODQ06828 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FMODQ06828 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FMODQ06828 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FMODQ06828 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FMODQ06828 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FMODQ06828 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FMODQ06828 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FMODQ06828 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FMODQ06828 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FMODQ06828 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FMODQ06828 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FMODQ06828 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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