Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSME1Q06323 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSME1Q06323 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms