Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DEUP1Q05D60 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms