Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNEQ04844 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms