Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms