Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP2C1P98194 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms