Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM3AP98173 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms