Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PITX1P78337 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX1P78337 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITX1P78337 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITX1P78337 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITX1P78337 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITX1P78337 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITX1P78337 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITX1P78337 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITX1P78337 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX1P78337 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX1P78337 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX1P78337 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX1P78337 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX1P78337 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX1P78337 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX1P78337 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms