Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HERVK_113P62684 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms