Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 C15orf40-209ENST00000538348 561 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
EMP3P54852 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 C9orf85-203ENST00000377031 1107 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 AC105999.2-203ENST00000521030 663 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 AC010487.2-201ENST00000594546 486 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EMP3P54852 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EMP3P54852 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EMP3P54852 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
EMP3P54852 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
EMP3P54852 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms