Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HLCSP50747 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLCSP50747 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLCSP50747 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLCSP50747 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLCSP50747 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLCSP50747 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLCSP50747 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLCSP50747 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLCSP50747 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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HLCSP50747 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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HLCSP50747 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLCSP50747 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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HLCSP50747 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLCSP50747 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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HLCSP50747 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLCSP50747 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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HLCSP50747 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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HLCSP50747 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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HLCSP50747 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLCSP50747 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLCSP50747 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLCSP50747 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HLCSP50747 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLCSP50747 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLCSP50747 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLCSP50747 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HLCSP50747 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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HLCSP50747 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLCSP50747 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLCSP50747 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLCSP50747 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLCSP50747 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLCSP50747 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLCSP50747 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLCSP50747 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLCSP50747 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLCSP50747 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLCSP50747 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLCSP50747 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLCSP50747 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HLCSP50747 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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