Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GGCXP38435 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GGCXP38435 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GGCXP38435 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GGCXP38435 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GGCXP38435 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GGCXP38435 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GGCXP38435 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GGCXP38435 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GGCXP38435 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms