Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRHP20396 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC010894.2-201ENST00000444196 561 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRHP20396 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRHP20396 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRHP20396 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRHP20396 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRHP20396 EIF2B5-202ENST00000432569 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms