Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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PTPRAP18433 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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PTPRAP18433 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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PTPRAP18433 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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PTPRAP18433 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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