Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GM2AP17900 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GM2AP17900 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GM2AP17900 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GM2AP17900 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms