Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB3P14651 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 AC084759.2-202ENST00000557976 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 AC015849.4-201ENST00000603678 421 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB3P14651 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HOXB3P14651 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB3P14651 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB3P14651 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB3P14651 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB3P14651 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB3P14651 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB3P14651 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB3P14651 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB3P14651 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB3P14651 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB3P14651 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB3P14651 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HOXB3P14651 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB3P14651 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB3P14651 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB3P14651 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB3P14651 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXB3P14651 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HOXB3P14651 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms