Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PRF1P14222 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms