Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD8P13378 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms