Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

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Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODC1P11926 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODC1P11926 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ODC1P11926 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms