Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRNB1P11230 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms