Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms