Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EXTL3O43909 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms