Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COCHO43405 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COCHO43405 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COCHO43405 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COCHO43405 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COCHO43405 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COCHO43405 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COCHO43405 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COCHO43405 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COCHO43405 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COCHO43405 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COCHO43405 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COCHO43405 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COCHO43405 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COCHO43405 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms