Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BCKDKO14874 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDKO14874 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms