Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USP17L12C9JPN9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms