Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGB1P1B2RPK0 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms