Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD1B0YJ81 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HACD1B0YJ81 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms