Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E2F8A0AVK6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms