Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ERVW-1Q9UQF0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms