Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AFF4Q9UHB7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms