Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNAL1Q9UBT7 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNAL1Q9UBT7 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms