Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CHST12Q9NRB3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHST12Q9NRB3 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms