Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms