Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms