Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SLC6A20Q9NP91 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SLC6A20Q9NP91 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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