Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEP44Q9C0F1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms